Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GANQ9H2C0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms