Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SRCIN1Q9C0H9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCIN1Q9C0H9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms