Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms