Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT23Q9C075 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms