Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM6SF1Q9BZW5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM6SF1Q9BZW5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM6SF1Q9BZW5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM6SF1Q9BZW5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TM6SF1Q9BZW5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TM6SF1Q9BZW5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms