Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms