Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms