Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms