Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SHANK3Q9BYB0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK3Q9BYB0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms