Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC3Q9BY71 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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