Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms