Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms