Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms