Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms