Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UHRF1Q96T88 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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