Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms