Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms