Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD6Q96NK8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms