Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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C9orf85Q96MD7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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C9orf85Q96MD7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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C9orf85Q96MD7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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