Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms