Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms