Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00477Q96M19 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms