Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP8Q96LD8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms