Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms