Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms