Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL48Q96GC5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL48Q96GC5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL48Q96GC5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL48Q96GC5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL48Q96GC5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL48Q96GC5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL48Q96GC5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL48Q96GC5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL48Q96GC5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL48Q96GC5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL48Q96GC5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL48Q96GC5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL48Q96GC5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms