Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SGF29Q96ES7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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