Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC59Q96AG4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC59Q96AG4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms