Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms