Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms