Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms