Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMO7Q8WWI1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms