Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
BRK1Q8WUW1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms