Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms