Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC4Q8TBB5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC4Q8TBB5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms