Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms