Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms