Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms