Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM199Q8N511 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM199Q8N511 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms