Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms