Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC103Q8IW40 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms