Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVV2

LOXHD1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXHD1Q8IVV2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXHD1Q8IVV2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms