Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms