Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA4Q8IV77 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA4Q8IV77 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA4Q8IV77 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA4Q8IV77 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA4Q8IV77 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA4Q8IV77 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA4Q8IV77 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA4Q8IV77 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA4Q8IV77 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA4Q8IV77 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNGA4Q8IV77 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNGA4Q8IV77 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNGA4Q8IV77 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNGA4Q8IV77 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms