Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms