Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF3Q86WH2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF3Q86WH2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms