Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT9Q86SS6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms