Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms