Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTZ2

USP17L1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 1, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L1Q7RTZ2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L1Q7RTZ2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L1Q7RTZ2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L1Q7RTZ2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L1Q7RTZ2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L1Q7RTZ2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L1Q7RTZ2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L1Q7RTZ2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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