Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
STRCQ7RTU9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms